Компьютерный дизайн водорастворимого аналога β-галактозил-церамида 

ОИПИ НАН Беларуси совместно ИБОХ НАН Беларуси и РНПЦ ЭМ МЗ РБ впервые осуществлен компьютерный дизайн водорастворимого аналога β-галактозил-церамида - потенциального ингибитора репликации ВИЧ-1 – на основе анализа межмолекулярных взаимодействий интактного гликолипида с центральной областью петли V3 белка gp120 оболочки вируса. Путем расчета величин свободной энергии образования комплексов этого производного β-GalCer с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления им противовирусной активности. Данные компьютерного моделирования подтверждены результатами первичных медицинских испытаний синтезированного соединения. В связи с этим, сконструированный аналог <β-GalCer может рассматриваться как базовая структура для создания его модифицированных форм, ингибирующие свойства которых, как следует из проведенных исследований, могут быть корректно оценены методами молекулярного моделирования. 
Такой подход к разработке новых лекарственных препаратов для терапии СПИДа, предполагающий использование на первом этапе исследований современных компьютерных методологий, позволяет провести рациональный отбор наиболее перспективных молекул, способных к эффективной блокаде петли V3 ВИЧ-1, с целью их последующего синтеза и тестирования на анти-ВИЧ активность. 
	
Рис. 1. Наиболее характерные структурные комплексы пептидов Gly-Pro-Gly-Gln-Ala-Phe (а) и Gly-Pro-Gly-Arg-Ala-Phe (б) петли V3 ВИЧ-1 с аналогом β-GalCer, построенные методами компьютерного молекулярного моделирования. Пунктирными линиями обозначены водородные связи. Использованы следующие условные обозначения: Gal — галактоза, Sph — сфингозиновое основание 	
Результаты исследования могут быть использованы в работах для Министерства здравоохранения РБ по созданию на основе гликолипидов новых эффективных анти-ВИЧ агентов, блокирующих критический для клеточного тропизма участок оболочки вируса 

Научный руководитель: Тузиков А.В., Еремин В.Ф.,  Андрианов А.М.
Ответственный исполнитель: Анищенко И.В.
Год: 2011
Ключевые слова: Компьютерный дизайн, ВИЧ-1, СПИД